Одним из наиболее ярких показателей количественных и качественных преобразований флоры является изменение ее таксономической структуры, которая отражает многообразие морфологической и функциональной организации видов, составляющих флористический комплекс. Таксономическое разнообразие морской альгофлоры – макрофитобентоса – определяется численностью и соотношением таксонов разного иерархического уровня. Наиболее простыми, но достаточно показательными характеристиками изменения флоры являются изменения соотношений численности отделов Chlorophyta, Phaeophyta и Rhodophyta. Полученные данные показывают: макрофитобентос крупной экосистемы проявляет устойчивость к антропогенному воздействию и в течение длительного времени способен сохранять свое видовое богатство; изменение видового состава макрофитобентоса под воздействием загрязнения происходит не хаотично, а подчиняется определенным закономерностям, которые направлены на сохранение таксономической структуры флоры; на относительно небольших участках прибрежья оценку экологического состояния морской среды можно делать по изменению таксономических пропорций, но с их помощью нельзя оценить экологическое состояние крупных экосистем.